朱由榔可是清楚，堵胤锡此次太狠了，朱由榔可不会再放心让他掌军了，这种强硬驱使士兵死战，可一不可二，要不然，这军心可就散了。
一个月后，朱由榔在全州一一关注着李元胤于清庭的远作，此时，陈友龙南宁都司已经组编人员也发来朱由榔手上。
朱由榔盯着南宁都司的大小将领名单，片刻后，朱由榔又拿起有关于湖广江西的情报，金声恒王得仁已经被清庭搞烦了，他们更是收缩兵力，暗中向社永和示意，是不愿开战的。
看到这些，朱由榔摸了摸客头：“下旨，令大督府与兵部合议，在全军调动将领，凡旗队将领调动不得同在一营，营将以下者，不得在同一卫，营将并营将以上者，不得在同都，凡亲军出任他军者，视外军高一级，凡外军调入亲卫者，降级调入。”
丁思良张大张口望着朱由榔，片刻间，丁思良拿出小册记了下来，丁思良虽然有级大的凝问，但他可不敢开声。
朱由榔背着手站于行在窗外：“令大督府与兵部合议，编组军队，俱按戚继光之练兵实纪之法编组，营卫都按何腾蛟之制编组，但保留亲军门卫，凡士兵俱统一编号入册，见号能知所在之队伍，一个月凡，朕要看到花名册，二个月凡，诸军编组完成。”
说到此时，朱由榔又盯着李元胤送回的消息：“江西湖广二地，近期无战事，令内阁兵部加快，军政交接，以后，军队调动，无皇令不得调，政事，军队不得参与，军队诸事，俱属大督府兵部共管，在大督府设一军法司，专掌军法审判之职，以后，士兵除犯民事由三司与军法司共审判外，一切军事由大督府兵部共管。”
待丁思良记完之后，朱由榔却挥了挥：“令何腾蛟归广州候用，其三卫调赣州由社永和统领，在赣州三卫亲军，回军广州候令。”
朱由榔一口气下完多条命令后，他才松了口气，就在此时，张福禄的声音却传了进来。
“陛下，广州有密折传来。”
“进来吧。”朱由榔皱着眉头望着门外。
片刻间，张福禄跪于朱由榔面前递上了一封密折，朱由榔拿过细看之下，脸色略有不喜。
原来此密折是有关于船厂有关造船的，但只际记到大福船每艘只能配装三四十门红夷大炮。
想到此，是加强型红夷大炮，朱由榔却是十分不满意。
“下令水师编组，按二艘一组十组一队，三队一都，暂编一都水师，由陈子壮之弟陈子升任此水师都指挥使，由叶如日任都指挥同知，调袁宗第任都指挥佥事，其下诸将由大督府选调，待朕回到广州时，朕要看到名单。”
朱由榔说到此时，又想起了什么，又道：“严令船厂造大福船年要造一都大福船出来，所用般料可交由船政局由海外购进。”
“是陛下。”
一个月后，李元胤满脸兴奋地回到全州。
原来，此事，不用李元胤开声，有许多旧归降于清庭的大明官员一见耿仲明有机可乘后，他们便如同吃人鱼见着血似的，猛得对着耿仲明怼了起来，他们发挥了在大明怼皇帝的威势。
再加上多尔滚也看耿仲明不顺眼，所以这一风波似大有格杀耿仲明之意。
再重要的是，清庭已经令孔有德尚可喜耿仲明领兵回京，湖广诸地清庭任命之官大有逃弃之举。
见此，朱由榔松了一口气，他背着手走了几步后，双眼猛得一瞪：“下旨，令章旷令兵随朕回广州，由王兴守永州，余龙守全州，其余诸军各归其营，待调任将领。”
“是，陛下。”
而此时，在长沙，耿仲明满脸死色地躺在房间，他回到长沙后，他想过自杀，想过辞职，他可是清楚，朱由榔送他回来，必定是不安好心的。